RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 HBP1O60381 514 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 EVI5O60447 810 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ACTR2P61160 394 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RBP5P82980 135 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 IER5Q5VY09 327 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 MED24O75448 989 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TNIP3Q96KP6 325 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 GPC4O75487 556 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TAP1Q03518 808 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 MCUQ8NE86 351 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 HDAC11Q96DB2 347 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ASPHQ12797 758 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 EPHB1P54762 984 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ERO1BQ86YB8 467 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 HVCN1Q96D96 273 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 GYPCP04921 128 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 GALCP54803 685 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CAV1Q03135 178 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 PLSCR1O15162 318 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 WDR70Q9NW82 654 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ESYT3A0FGR9 886 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CREB3O43889 395 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ARP10275 920 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CA4P22748 312 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 VCAM1P19320 739 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 MAP7Q14244 749 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 35.5
LRP5-201ENST00000294304 VCX3BQ9H321 246 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 LAMC2Q13753 1193 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 LRRC31Q6UY01 552 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 TTC1Q99614 292 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 KRT10P13645 584 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP5-201ENST00000294304 BCAR1P56945 870 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 COG7P83436 770 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 SNX12Q9UMY4 172 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 IFT88Q13099 833 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 DACT2Q5SW24 774 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 A0A1W2PQJ5 194 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 CTSHP09668 335 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 C18orf8Q96DM3 657 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 VCXQ9H320 206 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 POLIQ9UNA4 740 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 EXOC4Q96A65 974 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 FAM187AA6NFU0 413 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP5-201ENST00000294304 HLA-DRAP01903 254 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.7 ms