RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261024.6

SLC40A1-201, Transcript of solute carrier family 40 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC40A1, Length 3,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1-201ENST00000261024 CYTH2Q99418 400 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 COG5Q9UP83 839 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 USP17L3A6NCW0 530 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 USP17L4A6NCW7 530 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LIN52Q52LA3 116 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 GALNT17Q6IS24 598 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 OSCARQ8IYS5 282 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 WDR91A4D1P6 747 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 EXOC3O60645 756 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 TTC4O95801 387 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 AAASQ9NRG9 546 aa15.94■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 RGPD5Q99666 1765 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 TMEM253P0C7T8 217 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 MOGSQ13724 837 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 PALB2Q86YC2 1186 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 TMCO1Q9UM00 188 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 ECE2O60344 883 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 BAG2O95816 211 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 TNFAIP3P21580 790 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 GNA11P29992 359 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KRT17Q04695 432 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 AP1B1Q10567 949 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 OVGP1Q12889 678 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KRT82Q9NSB4 513 aa15.93■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 PDLIM1O00151 329 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CCDC22O60826 627 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LMNB1P20700 586 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 P3H1Q32P28 736 aa15.93■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 KLRF2D3W0D1 207 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LRRN2O75325 713 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KRT15P19012 456 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 SERPINB3P29508 390 aa15.92■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 MAP7Q14244 749 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.92■□□□□ 0.14
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SLC40A1-201ENST00000261024 TTC1Q99614 292 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CLIC2O15247 247 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 CHRNB2P17787 502 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 ZBTB16Q05516 673 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 SPARCL1Q14515 664 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 DDB1Q16531 1140 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 SPATA24Q86W54 205 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 C10orf82Q8WW14 230 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC40A1-201ENST00000261024 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.92■□□□□ 0.14
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