RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 RNF40O75150 1001 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PPP1R2P41236 205 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC38Q502W7 563 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MGARPQ8TDB4 240 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KLK14Q9P0G3 267 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KNL1Q8NG31 2342 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 LAMB1P07942 1786 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 BCRP11274 1271 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 YY1P25490 414 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 AMPD2Q01433 879 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TRAF1Q13077 416 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KIZQ2M2Z5 673 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 C7orf31Q8N865 590 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CLDN3O15551 220 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CYP2B6P20813 491 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 EPHX2P34913 555 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 RABGGTBP53611 331 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NT5C1BQ96P26 610 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 RIT2Q99578 217 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MRIQ9BWK5 157 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 AMFRQ9UKV5 643 aa9.8□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 HSD17B4P51659 736 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KRT76Q01546 638 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 WDR44Q5JSH3 913 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KCNT1Q5JUK3 1230 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NLRP7Q8WX94 980 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NUP85Q9BW27 656 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TBK1Q9UHD2 729 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PFASO15067 1338 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PTPRJQ12913 1337 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PIK3CDO00329 1044 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 EDN1P05305 212 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CTSHP09668 335 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FLT3P36888 993 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TRPC3Q13507 836 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TERF2Q15554 542 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ARL8AQ96BM9 186 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FIZ1Q96SL8 496 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.79□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC151A5D8V7 595 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PDE6CP51160 858 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PLCB4Q15147 1175 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 AFG1LQ8WV93 481 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 C18orf8Q96DM3 657 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MMP19Q99542 508 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SIX2Q9NPC8 291 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 COG5Q9UP83 839 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF233A6NK53 670 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 FZD9O00144 591 aa9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KRT10P13645 584 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms