RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 EXTL3O43909 919 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TOM1L1O75674 476 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 KRT13P13646 458 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GCLMP48507 274 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 C1QTNF8P60827 252 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CEP120Q8N960 986 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 OSMRQ99650 979 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MAPK13O15264 365 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CLDN3O15551 220 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PON1P27169 355 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TERF1P54274 439 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 POU5F1BQ06416 359 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TCHPQ9BT92 498 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GCNT4Q9P109 453 aa20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PROZP22891 400 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PTPRJQ12913 1337 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM14Q14142 442 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF6Q15052 776 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ZEB2O60315 1214 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MYL7Q01449 175 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GJB7Q6PEY0 223 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CNGA4Q8IV77 575 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 NEK11Q8NG66 645 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GANQ9H2C0 597 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 SIX2Q9NPC8 291 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TSPAN1O60635 241 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PRMT2P55345 433 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MCL1Q07820 350 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MTF1Q14872 753 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.86■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 ZNF410Q86VK4 478 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM192Q8IY95 271 aa20.86■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 PANX2Q96RD6 677 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CDT1Q9H211 546 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.86■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ANK1P16157 1881 aa20.86■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 ZNF233A6NK53 670 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ACLYP53396 1101 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 OSTNP61366 133 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GBP6Q6ZN66 633 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.85■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 WDR59Q6PJI9 974 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 RNF180Q86T96 592 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF516Q92618 1163 aa20.85■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 DNAJC7Q99615 494 aa20.85■□□□□ 0.93
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DUSP1-201ENST00000239223 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 CHP1Q99653 195 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.931e-6■■□□□ 13.5
DUSP1-201ENST00000239223 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.84■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 A0A1W2PQJ5 194 aa20.83■□□□□ 0.93
DUSP1-201ENST00000239223 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
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