RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	HTB2	P02294	131 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MRS3	P10566	314 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	HEM15	P16622	393 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SLY1	P22213	666 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MRPL6	P32904	214 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YOX1	P34161	385 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	VPS51	P36116	164 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MST28	P39552	234 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YNL320W	P42840	284 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPC17	P47076	161 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	AVT4	P50944	713 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MST27	P53176	234 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	GET1	P53192	235 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	BCH1	Q05029	724 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CDD1	Q06549	142 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CTR3	Q06686	241 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	LOT6	Q07923	191 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TMS1	Q12116	473 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPO26	P20435	155 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	AST1	P35183	429 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RCK2	P38623	610 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	KRE9	P39005	276 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YFL040W	P43562	540 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	HOC1	P47124	396 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	VEL1	P53058	206 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	NDE2	Q07500	545 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	DDC1	Q08949	612 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	NAM9	P27929	486 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PEX3	P28795	441 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MRX3	P38172	270 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YBP1	P38315	674 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SUR2	P38992	349 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YJR012C	P47087	207 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TIS11	P47977	285 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MRM2	P53123	320 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	DIA1	P54005	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SNX41	Q04053	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CDC123	Q05791	360 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RSA1	Q08932	381 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CSM4	Q08955	156 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	GPM2	Q12008	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CBS2	P14905	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	POF1	P25576	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ADE1	P27616	306 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MTC6	P38849	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	COX14	P39103	70 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ASG7	P46993	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MTQ1	P53944	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ARK1	P53974	638 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PRM15	Q03262	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	VIK1	Q12045	647 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PER33	Q12144	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PCL9	Q12477	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CTA1	P15202	515 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ERD1	P16151	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	SNF6	P18888	332 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CMK2	P22517	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TRM5	P38793	499 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	MTW1	P39731	289 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	GDS1	P41913	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PMT4	P46971	762 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	PIR3	Q03180	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TFC7	Q12415	435 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	TFS1	P14306	219 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	YAK1	P14680	807 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	RIB5	P38145	238 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	ECM8	P38246	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YKR104W	YKR104W	CUE1	P38428	203 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.1 ms