RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM49CP0CI26 452 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 APPL2Q8NEU8 664 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 SUN2Q9UH99 717 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 COPEO14579 308 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB2O15479 319 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 KIF19Q2TAC6 998 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF235Q14590 738 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDP1-208ENST00000613122 CCT5P48643 541 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDP1-208ENST00000613122 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDP1-208ENST00000613122 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 MX2P20592 715 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-208ENST00000613122 RFC5P40937 340 aa21.42■■□□□ 1.02
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