RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 PBX3P40426 434 aa18.97■□□□□ 0.63
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HERC3-214ENST00000601319 SLC12A3P55017 1021 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-214ENST00000601319 KRT17Q04695 432 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-214ENST00000601319 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.97■□□□□ 0.63
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HERC3-214ENST00000601319 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.95■□□□□ 0.62
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HERC3-214ENST00000601319 CCDC169A6NNP5 214 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.92■□□□□ 0.62
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HERC3-214ENST00000601319 PLS3P13797 630 aa18.92■□□□□ 0.62
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HERC3-214ENST00000601319 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 GRIK3Q13003 919 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 SLC39A14Q15043 492 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 DUSP6Q16828 381 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-214ENST00000601319 ARSHQ5FYA8 562 aa18.92■□□□□ 0.62
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