RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RGL1Q9NZL6 768 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 IPPQ9Y573 584 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR23AA6NEV1 266 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 C2CD2LO14523 706 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX28O15482 410 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN1O60635 241 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ERLIN2O94905 339 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EFEMP2O95967 443 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ADH1AP07327 375 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA4P13612 1032 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NPR3P17342 541 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 AOC1P19801 751 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 AXLP30530 894 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 AK2P54819 239 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DSC1Q08554 894 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SCRN1Q12765 414 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 XKR9Q5GH70 373 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FLCNQ8NFG4 579 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DYDC2Q96IM9 177 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MTRQ99707 1265 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 STK36Q9NRP7 1315 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL5CA6NH57 179 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB39O15060 712 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PI15O43692 258 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKL5O76039 1030 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GLUD1P00367 558 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 XBP1P17861 261 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MLH1P40692 756 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1G1P47890 313 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GLUD2P49448 558 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PTENP60484 403 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4A11Q02928 519 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NOTUMQ6P988 496 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 POTEDQ86YR6 584 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 OXER1Q8TDS5 423 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC51Q96ER9 411 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GAD1Q99259 594 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CSRNP2Q9H175 543 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF39Q9H2S5 420 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DPP7Q9UHL4 492 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 HES2Q9Y543 173 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM186AA6NE01 2351 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CLUHO75153 1309 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 F8W810 466 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCH6O60337 910 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PAPLNO95428 1278 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SCNN1GP51170 649 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DSG1Q02413 1049 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 POU5F1BQ06416 359 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SIX5Q8N196 739 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 STAMQ92783 540 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CPB2Q96IY4 423 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP42Q96MM3 310 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST7Q9NS84 486 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MIOSQ9NXC5 875 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM205CA6NFA0 338 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NR1I2O75469 434 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RFPL2O75678 378 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms