RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOX2	Q96NM4	488 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOM1L1	O75674	476 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPN2	P17655	700 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASP4	P49662	377 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	THAP9	Q9H5L6	903 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLDN3	O15551	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAND2	O75155	1236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP3	O75969	853 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPM4	P67936	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFIL3	Q16649	462 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0B4J269	797 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC3	O60645	756 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GHR	P10912	638 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GART	P22102	1010 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81	6e-6	■■■■□ 21.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNJ18	B7U540	433 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABLIM1	O14639	778 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROZ	P22891	400 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBL2	Q08999	1139 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNJ12	Q14500	433 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GUA9	196 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	BFSP2	Q13515	415 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LPIN1	Q14693	890 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PITPNM1	O00562	1244 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP5Z1	O43299	807 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SELP	P16109	830 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD52	P31358	61 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCL1	Q07820	350 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81	3e-6	■■■■□ 26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms