RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ESYT3A0FGR9 886 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC34A8MYJ7 566 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP7A1P22680 504 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ADD2P35612 726 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CRY2Q49AN0 593 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MDM1Q8TC05 714 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TLCD1Q96CP7 247 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 AIFM3Q96NN9 605 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT12Q99456 494 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 USP20Q9Y2K6 914 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SPTLC1O15269 473 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SERPINB7O75635 380 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CTDNEP1O95476 244 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UBXN1Q04323 297 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM13CQ8NE31 585 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TPK1Q9H3S4 243 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UFL1O94874 794 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GJB6O95452 261 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CSF1RP07333 972 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP2C9P11712 490 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MARK3P27448 753 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 EPS15P42566 896 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PCYT1AP49585 367 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PDXDC1Q6P996 788 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS36Q86VN1 386 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP4X1Q8N118 509 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PNMA2Q9UL42 364 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 JAG2Q9Y219 1238 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC27P30260 824 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ARFIP2P53365 341 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RELAQ04206 551 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF43Q68DV7 783 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SP8Q8IXZ3 490 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM17Q9Y577 477 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP350Q5VT06 3117 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 H0YGN5 161 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 FBP2O00757 339 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 AGTP01019 485 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 STX17P56962 302 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 KAZNQ674X7 775 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 NOX5Q96PH1 765 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAJC7Q99615 494 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS16Q9H269 839 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 GGT7Q9UJ14 662 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 NFS1Q9Y697 457 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 PRKAB2O43741 272 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 HOXD10P28358 340 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-218ENST00000590367 COPB2P35606 906 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms