RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TECP42680 631 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ERVFRD-1P60508 538 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 BLMHQ13867 455 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 NOMO1Q15155 1222 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 DGKDQ16760 1214 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 NME8Q8N427 588 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 GPR156Q8NFN8 814 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 IL31RAQ8NI17 732 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 KIAA1191Q96A73 305 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35A4Q96G79 324 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC23Q9UJX2 597 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.43□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAMTS3O15072 1205 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 NCK2O43639 380 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PHF2O75151 1096 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 FGF18O76093 207 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 IL18RAPO95256 599 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 RAC2P15153 192 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TSHRP16473 764 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MAN1A1P33908 653 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 DDIT3P35638 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 GDNFP39905 211 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PFKPQ01813 784 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 DAG1Q14118 895 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB39AQ14964 217 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PROSER1Q86XN7 944 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 GCC1Q96CN9 775 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SHISA4Q96DD7 197 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX11Q96FC9 970 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TBATAQ96M53 351 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SAMD11Q96NU1 681 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ARMT1Q9H993 441 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TDP1Q9NUW8 608 aa6.42□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 POM121BA6NF01 834 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 H3BUI4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MYO1FO00160 1098 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PRNPP04156 253 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TYRP14679 529 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 BDNFP23560 247 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 THBS2P35442 1172 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MAPK10P53779 464 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 NKX3-2P78367 333 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MGAT5Q09328 741 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 STILQ15468 1287 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CNGA2Q16280 664 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MAN2A1Q16706 1144 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC38Q502W7 563 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SUCLG2Q96I99 432 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 NT5C1BQ96P26 610 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PNPOQ9NVS9 261 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 RPTORQ8N122 1335 aa6.41□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 AKR1B10O60218 316 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MPOP05164 745 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC7A1P30825 629 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 MAPKAPK2P49137 400 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PRR5P85299 388 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PPFIA1Q13136 1202 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 PLS1Q14651 629 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 STARD3Q14849 445 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SEPT2Q15019 361 aa6.4□□□□□ -1.38
PIK3C3-211ENST00000589550 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms