RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-205ENST00000588780 FSHRP23945 695 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-205ENST00000588780 NECTIN1Q15223 517 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-205ENST00000588780 FRYLO94915 3013 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-205ENST00000588780 TGM5O43548 720 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC5A5Q92911 643 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 PARM1Q6UWI2 310 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 CNNM3Q8NE01 707 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP89Q96ST8 783 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 GAD1Q99259 594 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 APOL6Q9BWW8 343 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-205ENST00000588780 PSMD10O75832 226 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 PSMC5P62195 406 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 NTHL1P78549 312 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 FUT10Q6P4F1 479 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 ANO5Q75V66 913 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-205ENST00000588780 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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