RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	KCNC3	Q14003	757 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	POTEG	Q6S5H5	508 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	STK24	Q9Y6E0	443 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD2-208	ENST00000587269	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	DDHD2	O94830	711 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SUSD6	Q92537	303 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM122A	Q96E09	287 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	S1PR5	Q9H228	398 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	MUT	P22033	750 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	OR1G1	P47890	313 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PADI6	Q6TGC4	694 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	GAD1	Q99259	594 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	HES2	Q9Y543	173 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	IRAK3	Q9Y616	596 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ARL5C	A6NH57	179 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	NRP1	O14786	923 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	MLH1	P40692	756 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ITIH3	Q06033	890 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	RNF39	Q9H2S5	420 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	NPTXR	O95502	500 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82	4e-7	■■■■■ 35.6
SMAD2-208	ENST00000587269	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PARP2	Q9UGN5	583 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	B4GALT5	O43286	388 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	CYP11B2	P19099	503 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PPP2R5A	Q15172	486 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	AMHR2	Q16671	573 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	IFT74	Q96LB3	600 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	NR2E1	Q9Y466	385 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	LIG1	P18858	919 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	KLRC2	P26717	231 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	SCNN1G	P51170	649 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PTGDR	Q13258	359 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	PDIA5	Q14554	519 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	NBR1	Q14596	966 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SMAD2-208	ENST00000587269		A0A1B0GUA9	196 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	B4GALT3	O60512	393 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	AKAP5	P24588	427 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	MAPK6	Q16659	721 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB33	Q86T24	672 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	CABP7	Q86V35	215 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	EDA	Q92838	391 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269		H3BQV1	296 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	UROD	P06132	367 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	MTHFR	P42898	656 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PTPN14	Q15678	1187 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KRT79	Q5XKE5	535 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ZFP42	Q96MM3	310 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	LAD1	O00515	517 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	N4BP3	O15049	544 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	C2CD2L	O14523	706 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	INPPL1	O15357	1258 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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