RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SWAP70Q9UH65 585 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 USP27XA6NNY8 438 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.286e-14■□□□□ 8
CLTC-211ENST00000579815 MCM7P33993 719 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 KIR3DL1P43629 444 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RHBDL3P58872 404 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 JAG1P78504 1218 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 PAK1Q13153 545 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 STIM1Q13586 685 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NR1I3Q14994 352 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SOGA3Q5TF21 947 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 USP49Q70CQ1 688 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 REC114Q7Z4M0 266 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RELL1Q8IUW5 271 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 CNGA4Q8IV77 575 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SP8Q8IXZ3 490 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 DPF2Q92785 391 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 FEZ1Q99689 392 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 KCNK12Q9HB15 430 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 INTS13Q9NVM9 706 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TMEM232C9JQI7 657 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 KLRF2D3W0D1 207 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SLC26A4O43511 780 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 OR52Z1P0C646 297 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 PBX1P40424 430 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ETV3P41162 512 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 STAT6P42226 847 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 AFMP43652 599 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NAPAP54920 295 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 AMPD3Q01432 767 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 MESP2Q0VG99 397 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TUBB2AQ13885 445 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 KCNMB1Q16558 191 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ZNF827Q17R98 1081 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 GAB4Q2WGN9 574 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NEK8Q86SG6 692 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 HOMER1Q86YM7 354 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 CREG2Q8IUH2 290 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TMEM139Q8IV31 216 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TC2NQ8N9U0 490 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 IQCDQ96DY2 449 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 DNAI1Q9UI46 699 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 STX8Q9UNK0 236 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SHISA3A0PJX4 238 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 BICDL2A1A5D9 508 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 H7C1D1 291 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 CYTH3O43739 400 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 MFAP3LO75121 409 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 RHOBTB3O94955 611 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 HLA-DOAP06340 250 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SNHG28P0DPA3 235 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 SRFP11831 508 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 NPR1P16066 1061 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 ALDH1B1P30837 517 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 UBA7P41226 1012 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTC-211ENST00000579815 GABPAQ06546 454 aa7.03□□□□□ -1.28
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