RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1328Q86T90 577 aa31.64■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP31.58■■■□□ 2.657e-25■□□□□ 11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF5AQ12840 1032 aa31.58■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01465Q8N7H1 131 aa31.58■■■□□ 2.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOM1L1O75674 476 aa31.57■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC172P0C7W6 258 aa31.57■■■□□ 2.64
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