RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF862	O60290	1169 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	UCHL3	P15374	230 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ACLY	P53396	1101 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	NEDD9	Q14511	834 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1W2PQY0	241 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279		A6NJR5	290 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	DNM1L	O00429	736 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PSAP	P07602	524 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ACTR2	P61160	394 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GTF2B	Q00403	316 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ASIC2	Q16515	512 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MYH10	P35580	1976 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TISP43	B9A030	160 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SLC16A4	O15374	487 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MARK3	P27448	753 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CPT1A	P50416	773 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PEX3	P56589	373 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279		Q9Y3F1	56 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PJA2	O43164	708 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	EXOC3	O60645	756 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	LGALS2	P05162	132 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MAGEA1	P43355	309 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	FMO5	P49326	533 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	JAM2	P57087	298 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PCYT2	Q99447	389 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ENC1	O14682	589 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	PRKCE	Q02156	737 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	ARID5A	Q03989	594 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	DGKD	Q16760	1214 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TCF4-231	ENST00000566279	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.02	□□□□□ -0.64

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