RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 STIM1Q13586 685 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSC3Q14574 896 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 STX1AQ16623 288 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEPT8Q92599 483 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP290O15078 2479 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABLIM1O14639 778 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 FPGSQ05932 587 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOTUMQ6P988 496 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO10Q9NW15 660 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMA7O14818 248 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 N4BP3O15049 544 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLIC2O15247 247 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOM1L1O75674 476 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC192P0DO97 292 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PROZP22891 400 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADSSP30520 456 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R2P41236 205 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBXN11Q5T124 520 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CENPPQ6IPU0 288 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB33Q86T24 672 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NELFBQ8WX92 580 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 P2RX5Q93086 422 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAM2Q99965 735 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL23AQ9NPF7 189 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHST12Q9NRB3 414 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDXKO00764 312 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCNE1P24864 410 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPHB4P54760 987 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 STX17P56962 302 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 APBB2Q92870 758 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 MED15Q96RN5 788 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCHPQ9BT92 498 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDT1Q9H211 546 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLDN3O15551 220 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPTXRO95502 500 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAK1Q13153 545 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DACH1Q9UI36 760 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0B4J269 797 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 PFKMP08237 780 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCL1Q07820 350 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP120Q8N960 986 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC51Q96ER9 411 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGS18Q9NS28 235 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENPP3O14638 875 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 GARTP22102 1010 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEZ6Q53EL9 994 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTI2Q6NXR4 508 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF365Q70YC5 407 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCF2P10911 925 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms