RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PTENP60484 403 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 POU5F1BQ06416 359 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC39A14Q15043 492 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 USP49Q70CQ1 688 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TMC7Q7Z402 723 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CABP7Q86V35 215 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 BSNDQ8WZ55 320 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 DNM3Q9UQ16 869 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TECTAO75443 2155 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A0U1RQF3 1178 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNC3Q14003 757 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PLIN2Q99541 437 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CSRNP2Q9H175 543 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 POLD4Q9HCU8 107 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CHST12Q9NRB3 414 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 HCSTQ9UBK5 93 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC26A4O43511 780 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CASP10Q92851 521 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CLIC6Q96NY7 704 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 S1PR5Q9H228 398 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SKIP12755 728 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN5P54829 565 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 AMHR2Q16671 573 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SPECC1Q5M775 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 DAW1Q8N136 415 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF169Q8NCN4 708 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 EPSTI1Q96J88 318 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF19AQ9NV58 838 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NR2E1Q9Y466 385 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 UBA7P41226 1012 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PHKA2P46019 1235 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC12A3P55017 1021 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MAPK7Q13164 816 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CES5AQ6NT32 575 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXL6Q8N531 539 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PLCG1P19174 1290 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ITIH3Q06033 890 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TFDP1Q14186 410 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN21Q16825 1174 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 HIDE1A8MVS5 230 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G4BP0C869 781 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ARSHQ5FYA8 562 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 HELQQ8TDG4 1101 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM169Q96HH4 297 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TSPAN1O60635 241 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 YEATS4O95619 227 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 GUCY2CP25092 1073 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 GIT2Q14161 759 aa22.12■■□□□ 1.13
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