RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ANO10Q9NW15 660 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 DACT1Q9NYF0 836 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SPG21Q9NZD8 308 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 VAV3Q9UKW4 847 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SAMM50Q9Y512 469 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MYO10Q9HD67 2058 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 AP5Z1O43299 807 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 HOXA2O43364 376 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ATP8B1O43520 1251 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ZNF623O75123 536 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 DDHD2O94830 711 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LARGE1O95461 756 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 EFEMP2O95967 443 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TPM1P09493 284 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 EPCAMP16422 314 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LIG1P18858 919 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TMOD1P28289 359 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 AVPR2P30518 371 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PPM1AP35813 382 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 JAK3P52333 1124 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 NPEPPSP55786 919 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TPM4P67936 248 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FGD1P98174 961 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ST3GAL1Q11201 340 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 RESTQ13127 1097 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PTPN14Q15678 1187 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LONRF3Q496Y0 759 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MTERF2Q49AM1 385 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 XKR3Q5GH77 459 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 UBXN11Q5T124 520 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TMC7Q7Z402 723 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 RDM1Q8NG50 284 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 BICD2Q8TD16 824 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 NLRP7Q8WX94 980 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 HAS1Q92839 578 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 GTF3C6Q969F1 213 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 IGSF21Q96ID5 467 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CHST12Q9NRB3 414 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 IRAK3Q9Y616 596 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 A0A1W2PQ27 194 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 A0A1W2PQ64 194 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 A0A1W2PQD8 194 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ZBTB39O15060 712 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LILRB3O75022 631 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CXCL14O95715 111 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 GALTP07902 379 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 CTSAP10619 480 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SLC11A1P49279 550 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 NLRP5P59047 1200 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 KRT17Q04695 432 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SLC20A2Q08357 652 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 PPP2R5CQ13362 524 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 IQCB1Q15051 598 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 INF2Q27J81 1249 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 LUZP1Q86V48 1076 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-212ENST00000559276 ZNF410Q86VK4 478 aa6.5□□□□□ -1.37
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