RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.09■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.09■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 HES2Q9Y543 173 aa24.09■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 C5orf42Q9H799 3197 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 B4GALT3O60512 393 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 RPA1P27694 616 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 MLH1P40692 756 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 TRAPPC10P48553 1259 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 GAD1Q99259 594 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 RNF39Q9H2S5 420 aa24.08■■□□□ 1.45
CIPC-208ENST00000557115 ARL5CA6NH57 179 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NRP1O14786 923 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 B4GALT5O43286 388 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NR1I2O75469 434 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PLA2G5P39877 138 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 OR1G1P47890 313 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ITIH3Q06033 890 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 IRAK3Q9Y616 596 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ARID2Q68CP9 1835 aa24.07■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NPTXRO95502 500 aa24.06■■□□□ 1.44
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CIPC-208ENST00000557115 NBR1Q14596 966 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 AMHR2Q16671 573 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PADI6Q6TGC4 694 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 EDAQ92838 391 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 KIF3AQ9Y496 699 aa24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ST18O60284 1047 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SCNN1GP51170 649 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 RABEP1Q15276 862 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ZFP42Q96MM3 310 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PARP2Q9UGN5 583 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 NR2E1Q9Y466 385 aa24.05■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 EPCAMP16422 314 aa24.04■■□□□ 1.44
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CIPC-208ENST00000557115 KLRC2P26717 231 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PTPN14Q15678 1187 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB33Q86T24 672 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 CABP7Q86V35 215 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 DEPTORQ8TB45 409 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 RAB34Q9BZG1 259 aa24.04■■□□□ 1.44
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CIPC-208ENST00000557115 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 CDH22Q9UJ99 828 aa24.04■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 A0A1B0GUA9 196 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 C2CD2LO14523 706 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 URODP06132 367 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 LIG1P18858 919 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 CYP11B2P19099 503 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MUTP22033 750 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.03■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 INPPL1O15357 1258 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 WEE2P0C1S8 567 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MTHFRP42898 656 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ZXDAP98168 799 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 PTGDRQ13258 359 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MAPK6Q16659 721 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MCTP1Q6DN14 999 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 MIOSQ9NXC5 875 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 KLK14Q9P0G3 267 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 STK24Q9Y6E0 443 aa24.02■■□□□ 1.44
CIPC-208ENST00000557115 SOD2P04179 222 aa24.01■■□□□ 1.43
CIPC-208ENST00000557115 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CIPC-208ENST00000557115 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CIPC-208ENST00000557115 PPP2R5AQ15172 486 aa24.01■■□□□ 1.43
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