RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-208	ENST00000550718	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	KCNH6	Q9H252	994 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		7	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABHD16A	O95870	558 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	CFB	P00751	764 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GC	P02774	474 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	TAP1	Q03518	808 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PTPA	Q15257	358 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZG16B	Q96DA0	208 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	NDC1	Q9BTX1	674 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	IL2	P60568	153 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	RASSF3	Q86WH2	238 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	KDM1A	O60341	852 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	GAST	P01350	101 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	LAG3	P18627	525 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	ADRA1B	P35368	520 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	PPARA	Q07869	468 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MGAT5	Q09328	741 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	UBE3C	Q15386	1083 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GNPTAB-208	ENST00000550718	AHRR	A9YTQ3	701 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718		B5MCH6	92 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	RAB11FIP3	O75154	756 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	DDB1	Q16531	1140 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	BROX	Q5VW32	411 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718		A0A087X0B3	334 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	ENPP3	O14638	875 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	B3GALT2	O43825	422 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	PROZ	P22891	400 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	MGAT1	P26572	445 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	DHCR24	Q15392	516 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	TOR3A	Q9H497	397 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	COL4A3	Q01955	1670 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	BPI	P17213	487 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	APBA1	Q02410	837 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	ANO3	Q9BYT9	981 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZEB2	O60315	1214 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM127	O75204	238 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	BMPR1A	P36894	532 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	VRK3	Q8IV63	474 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GNPTAB-208	ENST00000550718	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3

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