RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-208ENST00000548896 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 TTLL1O95922 423 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 CEACAM5P06731 702 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 FGRP09769 529 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 FAM163BP0C2L3 166 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 CALM1P0DP23 149 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 CALM2P0DP24 149 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 CALM3P0DP25 149 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 USP14P54578 494 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 BACE1P56817 501 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 TFAP4Q01664 338 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 PRKCQQ04759 706 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 GABPAQ06546 454 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 BECN1Q14457 450 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 WTAPQ15007 396 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 RUFY3Q7L099 469 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 FEZ1Q99689 392 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 KAT14Q9H8E8 782 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.53□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.52□□□□□ -0.88
HECTD4-208ENST00000548896 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FOXP2O15409 715 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 MSCO60682 206 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CYP2D6P10635 497 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HMGCS2P54868 508 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ICA1Q05084 483 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DOCK1Q14185 1865 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 BRD3Q15059 726 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DGKHQ86XP1 1220 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HSCBQ8IWL3 235 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TRIB2Q92519 343 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 STX8Q9UNK0 236 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LZTS1Q9Y250 596 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PFASO15067 1338 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 NEDD4P46934 1319 aa9.52□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 VCANP13611 3396 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ALPK3Q96L96 1907 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PRDM1O75626 825 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LRIG2O94898 1065 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 EOMESO95936 686 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CD8BP10966 210 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RPS6KB1P23443 525 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 KIF5BP33176 963 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SHMT1P34896 483 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RGS2P41220 211 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LIG3P49916 1009 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 NEK4P51957 841 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PPP2R5BQ15173 497 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 KRT77Q7Z794 578 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FBRSQ9HAH7 460 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TNKSO95271 1327 aa9.51□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ENPP3O14638 875 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GH2P01242 217 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HOXC6P09630 235 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CTSHP09668 335 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CYP2B6P20813 491 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GNALP38405 381 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LIFRP42702 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RCAN1P53805 252 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HERVK_113P62684 666 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SEPT6Q14141 434 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 Q7L0L9 218 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms