RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 XKR3Q5GH77 459 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FGD4Q96M96 766 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MYH1P12882 1939 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CARNS1A5YM72 827 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 APOL1O14791 398 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NFIXQ14938 502 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM182BQ5T319 152 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C12orf60Q5U649 245 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MFAP3LO75121 409 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GRIK1P39086 918 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 STAT5BP51692 787 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CYP27A1Q02318 531 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 LAMC2Q13753 1193 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GTF2H3Q13889 308 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RNF180Q86T96 592 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 LZICQ8WZA0 190 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC138Q96M89 665 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NUP85Q9BW27 656 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PPME1Q9Y570 386 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KDM1AO60341 852 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KPNA6O60684 536 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MUTP22033 750 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CDC27P30260 824 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KCNQ4P56696 695 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RBP5P82980 135 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C2orf54Q08AI8 447 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DCLK2Q8N568 766 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ASIC4Q96FT7 647 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM51Q9NW97 253 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3R2O00459 728 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PRCPP42785 496 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 LDHDQ86WU2 507 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-226ENST00000546160 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PQC6 194 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KRT16P08779 473 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CPB1P15086 417 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GTF2A2P52657 109 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SNAP25P60880 206 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ST8SIA6P61647 398 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-226ENST00000546160 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MTMR2Q13614 643 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MCUQ8NE86 351 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C3P01024 1663 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-226ENST00000546160 SLC16A4O15374 487 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-226ENST00000546160 RCN2Q14257 317 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-226ENST00000546160 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 APPL2Q8NEU8 664 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PPCSQ9HAB8 311 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FLT1P17948 1338 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM187AA6NFU0 413 aa6.79□□□□□ -1.32
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