RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	BICD1	Q96G01	975 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FZD8	Q9H461	694 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	GDA	Q9Y2T3	454 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	RFXAP	O00287	272 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	KLRC4	O43908	158 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	B4GALT3	O60512	393 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	AMH	P03971	560 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	IPP	Q9Y573	584 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	MLH1	P40692	756 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SMTN	P53814	917 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SLC9A7	Q96T83	725 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ACKR2	O00590	384 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SLC26A4	O43511	780 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	STK4	Q13043	487 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	POSTN	Q15063	836 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477		A0A1B0GUA9	196 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477		F8W810	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	BIN1	O00499	593 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	DGKI	O75912	1065 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	POMC	P01189	267 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	HOXD13	P35453	343 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TNFSF9	P41273	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	UBE2H	P62256	183 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SPAG1	Q07617	926 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	DPYD	Q12882	1025 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	STRN3	Q13033	797 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-222	ENST00000539477	CDT1	Q9H211	546 aa		10.18	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms