RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	BRF1	Q92994	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CPLX1	O14810	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP2C8	P10632	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NOV	P48745	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GNAQ	P50148	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HERVK_113	P62684	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CRHR2	Q13324	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	IKZF1	Q13422	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PLS1	Q14651	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPN18	Q99952	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	VWA5A	O00534	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TLR2	O60603	784 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PLA2G6	O60733	806 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBED4	O75132	1171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CDKL5	O76039	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RXRA	P19793	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC16A2	P36021	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MCM2	P49736	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AK2	P54819	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCNA1	P78396	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZP2	Q05996	745 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TROAP	Q12815	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TRAF1	Q13077	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	STK3	Q13188	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MOGS	Q13724	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KIF22	Q14807	665 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GRM4	Q14833	912 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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