RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 A0A087WZ62 844 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 LAG3P18627 525 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 GLRA2P23416 452 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 CMA1P23946 247 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 ERVFC1P60507 584 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 COASYQ13057 564 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 MAPK7Q13164 816 aa20.58■□□□□ 0.89
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PUF60-218ENST00000531995 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.58■□□□□ 0.89
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PUF60-218ENST00000531995 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.58■□□□□ 0.89
PUF60-218ENST00000531995 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.57■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.57■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 STK17AQ9UEE5 414 aa20.57■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 ABI1Q8IZP0 508 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 NLRP7Q8WX94 980 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 TCF25Q9BQ70 676 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 PIEZO1Q92508 2521 aa20.56■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 POU5F1BQ06416 359 aa20.54■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 HELQQ8TDG4 1101 aa20.54■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 DHX58Q96C10 678 aa20.54■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 NLRP4Q96MN2 994 aa20.54■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 ZNF558Q96NG5 402 aa20.54■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 SFI1A8K8P3 1242 aa20.53■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 NDUFA8P51970 172 aa20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 PTENP60484 403 aa20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 RNF149Q8NC42 400 aa20.53■□□□□ 0.88
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PUF60-218ENST00000531995 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.53■□□□□ 0.88
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