RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 HMGA2P52926 109 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 KLF10Q13118 480 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 AMER2Q8N7J2 671 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 SNX33Q8WV41 574 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 IL17RAQ96F46 866 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 RAX2Q96IS3 184 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 EPC1Q9H2F5 836 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 ENPP1P22413 925 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 SLC25A3Q00325 362 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 RABL3Q5HYI8 236 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 MB21D1Q8N884 522 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 DOK3Q7L591 496 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 GASTP01350 101 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 CTSSP25774 331 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 FHL2Q14192 279 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 STAT4Q14765 748 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 PGBD4Q96DM1 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 ORAI2Q96SN7 254 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.25□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 HK1P19367 917 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 TGFB2P61812 414 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 APBA1Q02410 837 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.24□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.24□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.23□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 MTHFD2P13995 350 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 CRHR1P34998 444 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 VTA1Q9NP79 307 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-221ENST00000514231 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-221ENST00000514231 TMPRSS15P98073 1019 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 CDK17Q00537 523 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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PDE4D-221ENST00000514231 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.21□□□□□ -1.26
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PDE4D-221ENST00000514231 KCNK18Q7Z418 384 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 NDC1Q9BTX1 674 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 ZMYM3Q14202 1370 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 CNGA1P29973 690 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-221ENST00000514231 SCAND1P57086 179 aa7.2□□□□□ -1.26
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