RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CPB2Q96IY4 423 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CSRNP2Q9H175 543 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DPP7Q9UHL4 492 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CDH22Q9UJ99 828 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TECTAO75443 2155 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 URODP06132 367 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2B1P20020 1258 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ASIC4Q96FT7 647 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GAD1Q99259 594 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 APOL6Q9BWW8 343 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 USTQ9Y2C2 406 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL5CA6NH57 179 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C2CD2LO14523 706 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SOD2P04179 222 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 AVPR2P30518 371 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL2P36404 184 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 IER5LQ5T953 404 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 KANK3Q6NY19 840 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 LARGE1O95461 756 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ADH1AP07327 375 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MLH1P40692 756 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 RARRES1P49788 294 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CLCN4P51793 760 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR149Q86SP6 731 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR9Q96QG7 549 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 HES2Q9Y543 173 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 B4GALT3O60512 393 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 JAK2O60674 1132 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GLRA2P23416 452 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM7P33993 719 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.37■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.37■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 ERMNQ8TAM6 284 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF39Q9H2S5 420 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP2Q9UGN5 583 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 GLUD2P49448 558 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SCNN1GP51170 649 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NACC1Q96RE7 527 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C5orf42Q9H799 3197 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A087WWV3 80 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEMA6NI47 508 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 INPPL1O15357 1258 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 BRD1O95696 1058 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NUBP1P53384 320 aa21.35■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.35■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.35■■□□□ 1.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1B0GUA9 196 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NPTXRO95502 500 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GLUD1P00367 558 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ASGR2P07307 311 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 AKAP5P24588 427 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GUCY1B3Q02153 619 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 DSC1Q08554 894 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C8orf76Q96K31 380 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.34■■□□□ 1.01
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