RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971		A8MVJ9	347 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CETN3	O15182	167 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TIPRL	O75663	272 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GUCA1C	O95843	209 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGB1	P05556	798 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CAPN3	P20807	821 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDX5	P30044	214 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MCM5	P33992	734 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CHKA	P35790	457 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ADH7	P40394	386 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MAN2A2	P49641	1150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GJA9	P57773	515 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TGFB2	P61812	414 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKB2	Q00653	900 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LCORL	Q8N3X6	602 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DPF3	Q92784	378 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GJA10	Q969M2	543 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RUFY1	Q96T51	708 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT23	Q9C075	422 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MTFR1L	Q9H019	292 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ARMT1	Q9H993	441 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OBP2A	Q9NY56	170 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	EP400	Q96L91	3159 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SLX4	Q8IY92	1834 aa		7.34	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC69	A6NI79	296 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L21	D6R901	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR37L1	O60883	481 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPA1	O75762	1119 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PALM	O75781	387 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP1	O94782	785 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	BAG3	O95817	575 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC4A1	P02730	911 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP1A2	P05177	515 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	THEGL	P0DJG4	465 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CPA1	P15085	419 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CA8	P35219	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPK9	P45984	424 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNJ6	P48051	423 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	HDAC4	P56524	1084 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	GPS2	Q13227	327 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB33A	Q14088	237 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ME3	Q16798	604 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ODF2	Q5BJF6	829 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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