RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 UBE3CQ15386 1083 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC157Q569K6 752 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 HPS3Q969F9 1004 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 HDAC10Q969S8 669 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MVB12AQ96EY5 273 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 VWA7Q9Y334 891 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RPTORQ8N122 1335 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ERC2O15083 957 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 GAAP10253 952 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CTSSP25774 331 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 LINC00310P59036 64 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 IL10RAQ13651 578 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KCNA10Q16322 511 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PGS1Q32NB8 556 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 VWA3BQ502W6 1294 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KRT40Q6A162 431 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 DGKHQ86XP1 1220 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CARFQ8N187 725 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KAT5Q92993 513 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TIFAQ96CG3 184 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TLR9Q9NR96 1032 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 NCDNQ9UBB6 729 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SHROOM2Q13796 1616 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PR48 441 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 FFAR3O14843 346 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PLIN1O60240 522 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 NUAK1O60285 661 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM127O75204 238 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ALDH1A2O94788 518 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MYL1P05976 194 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 EDNRBP24530 442 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ECHS1P30084 290 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PPP3CAQ08209 521 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 GRM3Q14832 879 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MAP9Q49MG5 647 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RAB24Q969Q5 203 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TAAR9Q96RI9 348 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CD320Q9NPF0 282 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ING3Q9NXR8 418 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 IPPQ9Y573 584 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SH3D21A4FU49 640 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 C2orf78A6NCI8 922 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PHF2O75151 1096 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 ACAP1Q15027 740 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 LLGL1Q15334 1064 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC14AQ86T13 490 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 RSPH3Q86UC2 560 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 DRC7Q8IY82 874 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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