RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 MYL7Q01449 175 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 AAASQ9NRG9 546 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FAM13AO94988 1023 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CCND1P24385 295 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PDE6BP35913 854 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PEX5P50542 639 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MGAT5Q09328 741 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GRAPQ13588 217 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 KIF22Q14807 665 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CGB2Q6NT52 195 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RINT1Q6NUQ1 792 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PTF1AQ7RTS3 328 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CROCCP2Q86T23 111 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RHOT2Q8IXI1 618 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 NARFQ9UHQ1 456 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TP73O15350 636 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MSH4O15457 936 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SLC26A4O43511 780 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 DLATP10515 647 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 HSPA6P17066 643 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SNX1Q13596 522 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ASRGL1Q7L266 308 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf54Q8WWF1 131 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PWWP2AQ96N64 755 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FAM167BQ9BTA0 163 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ACP6Q9NPH0 428 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PASKQ96RG2 1323 aa11□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GNPATO15228 680 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 UPP2O95045 317 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GJB6O95452 261 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GBP1P32455 592 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SHMT1P34896 483 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PEX19P40855 299 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CALCOCO2Q13137 446 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CLUL1Q15846 466 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 USH1GQ495M9 461 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CYP4X1Q8N118 509 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 BATF3Q9NR55 127 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 OLFML3Q9NRN5 406 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TBK1Q9UHD2 729 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 VAV3Q9UKW4 847 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GAKO14976 1311 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CHMP2AO43633 222 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 EYA4O95677 639 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GPC5P78333 572 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 DLG4P78352 724 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 DNAJC18Q9H819 358 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 KIF9Q9HAQ2 790 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.99□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CLDN3O15551 220 aa10.98□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SPOPO43791 374 aa10.98□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ECEL1O95672 775 aa10.98□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CETPP11597 493 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms