RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EVI5O60447 810 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEJP0CG39 1038 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNA2P16389 499 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULF1Q8IWU6 871 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACAD9Q9H845 621 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFASO15067 1338 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADSSP30520 456 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPB2P35606 906 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPTX2P47972 431 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTR2P61160 394 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMC5P62195 406 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPC2Q52LR7 807 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX26Q7Z412 305 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM107BQ9H098 131 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGA4P13612 1032 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYL7Q01449 175 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCEQ02156 737 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.77■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCRP11274 1271 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLS3P13797 630 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BFSP1Q12934 665 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRP2Q13474 957 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LY6KQ17RY6 165 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSKSQ9UJT2 592 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR81Q562E7 1941 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRAK1P51617 712 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NNTQ13423 1086 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q3C1V9 767 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMBQ6PCB8 327 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BICD1Q96G01 975 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.76■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R37O75864 691 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF4AO95239 1232 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP38Q8NB14 1042 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARP14Q460N5 1801 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPA1O60313 960 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H2AFZP0C0S5 128 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT7BP56706 349 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAK2Q13177 524 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2CD6Q53TS8 623 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H2AFVQ71UI9 128 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL13Q8N6R0 699 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPS5Q92905 334 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPH5Q9H2P9 285 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMACRQ9UHK6 382 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSADQ9Y600 493 aa16.75■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEBLO76041 1014 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJB1P08034 283 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRIT1O00522 736 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP4AP20648 1035 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNNC1P63316 161 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms