RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488117.5

C9orf72-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 72, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf72, Length 4,808 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72-205ENST00000488117 PLSCR2Q9NRY7 297 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 UVRAGQ9P2Y5 699 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 RSPH14Q9UHP6 348 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 LRRIQ4A6NIV6 560 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 EBAG9O00559 213 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PODXLO00592 558 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SART1O43290 800 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 EXTL3O43909 919 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PPFIA4O75335 1185 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 TNNC2P02585 160 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 FTLP02792 175 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GARTP22102 1010 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CHRNA3P32297 505 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 HMGCS2P54868 508 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GNGT1P63211 74 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 JAG1P78504 1218 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GTF2BQ00403 316 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ENPEPQ07075 957 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 NEDD9Q14511 834 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MESDQ14696 234 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MUM1L1Q5H9M0 696 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CEP85LQ5SZL2 805 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 DENND2CQ68D51 928 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GJB7Q6PEY0 223 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 KCNV1Q6PIU1 500 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SLC30A10Q6XR72 485 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 TRIM72Q6ZMU5 477 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 NCAPG2Q86XI2 1143 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC125Q86Z20 511 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC77Q9BR77 488 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 TCHPQ9BT92 498 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 AP1M1Q9BXS5 423 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PACSIN1Q9BY11 444 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MTFR1LQ9H019 292 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GDF3Q9NR23 364 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 HOMER3Q9NSC5 361 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SCINQ9Y6U3 715 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 H3BQF6 201 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 OPLAHO14841 1288 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 EDIL3O43854 480 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 TLR2O60603 784 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ZBTB7AO95365 584 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GAS8O95995 478 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MAPK4P31152 587 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 RWDD2BP57060 319 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PRKCEQ02156 737 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 EMC2Q15006 297 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MAP4K3Q8IVH8 894 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SULF1Q8IWU6 871 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 DNERQ8NFT8 737 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CLEC4DQ8WXI8 215 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SAAL1Q96ER3 474 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SCLT1Q96NL6 688 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 FAM213AQ9BRX8 229 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 NUP85Q9BW27 656 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 C2orf40Q9H1Z8 148 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 CYP26B1Q9NR63 512 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PLAAQ9Y263 795 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MYPNQ86TC9 1320 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 K7ERI5 159 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 THAP12O43422 761 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 RAD51CO43502 376 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PHF2O75151 1096 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 OATP04181 439 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 GZMAP12544 262 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 P4HA1P13674 534 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 ITGB5P18084 799 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SLC1A1P43005 524 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 NPTX2P47972 431 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 EFNA5P52803 228 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 RTP1P59025 263 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 LMNB2Q03252 620 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 KCTD2Q14681 263 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 SLMAPQ14BN4 828 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 PTPROQ16827 1216 aa2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
C9orf72-205ENST00000488117 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms