RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	NPAT	Q14207	1427 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	RALBP1	Q15311	655 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	TBR1	Q16650	682 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	RNF180	Q86T96	592 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q8TCH9	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PMM1	Q92871	262 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD248	Q9HCU0	757 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	JAG2	Q9Y219	1238 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADGRB3	O60242	1522 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	RICTOR	Q6R327	1708 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	NOS1	P29475	1434 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	DVL2	O14641	736 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLIN1	O60240	522 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	CAND2	O75155	1236 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRL	P01236	227 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	GUCY2F	P51841	1108 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	TERF1	P54274	439 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADAM15	Q13444	863 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PPP2R5A	Q15172	486 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	NME9	Q86XW9	330 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	IQGAP1	P46940	1657 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	COMT	P21964	271 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	UBR7	Q8N806	425 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	MAML3	Q96JK9	1138 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	DIP2B	Q9P265	1576 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	IFT172	Q9UG01	1749 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	TSPAN6	O43657	245 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHBDL3	P58872	404 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	DGKD	Q16760	1214 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	PASD1	Q8IV76	773 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	NXPE1	Q8N323	547 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	MROH2A	A6NES4	1674 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	PIK3C2B	O00750	1634 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	MATN3	O15232	486 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	RAD17	O75943	681 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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