RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 NDST4Q9H3R1 872 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF302Q9NR11 478 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.72□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 EVPLQ92817 2033 aa6.71□□□□□ -1.33
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PQC6 194 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC169A6NNP5 214 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CETN3O15182 167 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PLS3P13797 630 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MARK3P27448 753 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KRT9P35527 623 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 COPB2P35606 906 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SERPINB4P48594 390 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CYP2J2P51589 502 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CCNA1P78396 465 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KCNMA1Q12791 1236 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PTK7Q13308 1070 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MORC4Q8TE76 937 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GIPC2Q8TF65 315 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM143Q96AN5 459 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CEP63Q96MT8 703 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PANX2Q96RD6 677 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CHP1Q99653 195 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KCND2Q9NZV8 630 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 USP20Q9Y2K6 914 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.71□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC35F4A4IF30 521 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KIF20AO95235 890 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TPM2P07951 284 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ACTN1P12814 892 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NPTX2P47972 431 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NCKAP1LP55160 1127 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CENPCQ03188 943 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GRM1Q13255 1194 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EMC2Q15006 297 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EML3Q32P44 896 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 XKR3Q5GH77 459 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 WDR59Q6PJI9 974 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GPR142Q7Z601 462 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms