RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKCAP17252 672 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGS1P23219 599 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FMO1Q01740 532 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PLS1Q14651 629 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NOMO1Q15155 1222 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC14A2Q15849 920 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 LCE2CQ5TA81 110 aa7.18□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF280DQ6N043 979 aa7.18□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.18□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS47A8MTI9 375 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 F8W8V4 182 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF787Q6DD87 383 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SESTD1Q86VW0 696 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC89Q8N998 374 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPC4 97 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX2O60749 519 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ARIH2O95376 493 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 TYRP14679 529 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NRG3P56975 720 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC42EP1Q00587 391 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR3DS1Q14943 382 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 CD276Q5ZPR3 534 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 PNPOQ9NVS9 261 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCF2Q9UG63 623 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G6O60733 806 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NPR1P16066 1061 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NFIAQ12857 509 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPT2Q15019 361 aa7.15□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB24Q969Q5 203 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF566Q969W8 418 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 STK33Q9BYT3 514 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEH1Q9H213 219 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 LRFN1Q9P244 771 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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