RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 SCLT1Q96NL6 688 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 GRIN2DO15399 1336 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 GPC3P51654 580 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP2-204ENST00000452765 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.81■■□□□ 1.24
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SH3BP2-204ENST00000452765 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.81■■□□□ 1.24
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SH3BP2-204ENST00000452765 NKX3-2P78367 333 aa22.78■■□□□ 1.24
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SH3BP2-204ENST00000452765 HOXC8P31273 242 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 GCLMP48507 274 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 VAMP7P51809 220 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 CCZ1BP86790 482 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 MYBPC2Q14324 1141 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 GPD1LQ8N335 351 aa22.77■■□□□ 1.24
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