RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441908.6

PQLC3-204, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PQLC3, Length 1,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-204ENST00000441908 C9IYK1 514 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 AMHP03971 560 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 HARSP12081 509 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.87■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 BIN1O00499 593 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 EFCAB14O75071 495 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 RHOBTB3O94955 611 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SMC2O95347 1197 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 LPPQ93052 612 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 TCHPQ9BT92 498 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 LIG4P49917 911 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 APOL6Q9BWW8 343 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 GBF1Q92538 1859 aa26.86■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SYCP3Q8IZU3 236 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ACCSQ96QU6 501 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.85■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 A0A0U1RQF3 1178 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 N4BP3O15049 544 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 HOXD13P35453 343 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 RABGGTBP53611 331 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 KCNB1Q14721 858 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SLC39A4Q6P5W5 647 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SPATA20Q8TB22 786 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MBD3O95983 291 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 FGFR1P11362 822 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 GATMP50440 423 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 TOP1MTQ969P6 601 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 GSDMAQ96QA5 445 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 HAPLN2Q9GZV7 340 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 IPPQ9Y573 584 aa26.84■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 OSTNP61366 133 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 PSMD2Q13200 908 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SEZ6Q53EL9 994 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 CEP120Q8N960 986 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 RNF39Q9H2S5 420 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.83■■□□□ 1.89
PQLC3-204ENST00000441908 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ALCAMQ13740 583 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 KCNN1Q92952 543 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 HVCN1Q96D96 273 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 SLC9A7Q96T83 725 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 CDT1Q9H211 546 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 RMND1Q9NWS8 449 aa26.82■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 TOM1L1O75674 476 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 AKAP5P24588 427 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 FAM189BP81408 668 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ZPBP2Q6X784 338 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 CCDC51Q96ER9 411 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 RNF19AQ9NV58 838 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ABLIM1O14639 778 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 CLDN3O15551 220 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 MYOGP15173 224 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 PROZP22891 400 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 ABCD1P33897 745 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.81■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 SCP2P22307 547 aa26.8■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 TMEM192Q8IY95 271 aa26.8■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.8■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.8■■□□□ 1.88
PQLC3-204ENST00000441908 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms