RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGRP01833 764 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 ADRB2P07550 413 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 TM4SF4P48230 202 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 DLG4P78352 724 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 MOGSQ13724 837 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM167AQ96KS9 214 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 PORCNQ9H237 461 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 EPC1Q9H2F5 836 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH10P35580 1976 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 31.8
SH3BP2-202ENST00000435136 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP4AP20648 1035 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 NAMPTP43490 491 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 METTL7BQ6UX53 244 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN18Q99952 460 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 MROH8Q9H579 483 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF186Q9NXI6 227 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 BUB1O43683 1085 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PALMO75781 387 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 MTERF2Q49AM1 385 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT39Q6A163 491 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GPD1LQ8N335 351 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM81BQ96LP2 452 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP89Q96ST8 783 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 NCANO14594 1321 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ARL2P36404 184 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SP4Q02446 784 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 MORC4Q8TE76 937 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PNKPQ96T60 521 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PAFAH1B1P43034 410 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GCLMP48507 274 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GPC3P51654 580 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM253P0C7T8 217 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 LBX1P52954 281 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP24A1Q07973 514 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF185O15231 689 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 STRN3Q13033 797 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 EXTL3O43909 919 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D8O95759 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC181Q5TID7 509 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 COG1Q8WTW3 980 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 PCYT2Q99447 389 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms