RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433535.6

RPUSD3-206, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD3, Length 1,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-206ENST00000433535 CNNM3Q8NE01 707 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 CCDC51Q96ER9 411 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 C8orf76Q96K31 380 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 FBXL18Q96ME1 805 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 CSRNP2Q9H175 543 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 MARCH5Q9NX47 278 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 ARL5CA6NH57 179 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NRP1O14786 923 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 MED24O75448 989 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 SCNN1GP51170 649 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 POU5F1BQ06416 359 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 PTPN21Q16825 1174 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 ZFP42Q96MM3 310 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 ALDH2P05091 517 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 ZNF174Q15697 407 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 POTEGQ6S5H5 508 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 NR2E1Q9Y466 385 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD3-206ENST00000433535 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 F8W810 466 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 INPPL1O15357 1258 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 OR1G1P47890 313 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 ZBTB33Q86T24 672 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 MIOSQ9NXC5 875 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KMT2EQ8IZD2 1858 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TRIOO75962 3097 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 C2CD2LO14523 706 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 NPTXRO95502 500 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 OR52Z1P0C646 297 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 MTHFRP42898 656 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 DSC1Q08554 894 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 CABP7Q86V35 215 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 URODP06132 367 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 AKAP5P24588 427 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KLRC2P26717 231 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 CLCN4P51793 760 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TTC38Q5R3I4 469 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 PLXNA3P51805 1871 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 LILRB3O75022 631 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SOD2P04179 222 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 NHLH1Q02575 133 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 NBR1Q14596 966 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 ASIC4Q96FT7 647 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KIF2CQ99661 725 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KCNH6Q9H252 994 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SFXN1Q9H9B4 322 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KLK14Q9P0G3 267 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 STK39Q9UEW8 545 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 C2orf16Q68DN1 1984 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 HACE1Q8IYU2 909 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 FBXL6Q8N531 539 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 ERMNQ8TAM6 284 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 BSNDQ8WZ55 320 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-206ENST00000433535 NACC1Q96RE7 527 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms