RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HELQQ8TDG4 1101 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIGKQ92643 395 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PXMP2Q9NR77 195 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VWA8A3KMH1 1905 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BSNQ9UPA5 3926 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KNTC1P50748 2209 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH3BP5O60239 455 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DKK1O94907 266 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HLA-EP13747 358 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GBP1P32455 592 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AK2P54819 239 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCINQ13939 588 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRM2Q14416 872 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL7BQ6UX53 244 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NME8Q8N427 588 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D5Q92609 795 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 URODP06132 367 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT10P13645 584 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC16A2P36021 539 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTX1Q13505 466 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RALBP1Q15311 655 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LILRA6Q6PI73 481 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GDE1Q9NZC3 331 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TGM5O43548 720 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBD4O95243 580 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCARP24071 287 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC14A1Q13336 389 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SBK1Q52WX2 424 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NXPE2Q96DL1 559 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOD2P04179 222 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFATC3Q12968 1075 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.91□□□□□ -0.82
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GDI1P31150 447 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC11A1P49279 550 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM228AQ86W67 206 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF4Q8WV16 495 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARNTLO00327 626 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF862O60290 1169 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG13O75143 517 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGBP1P78318 339 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEDD9Q14511 834 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC96Q2M329 555 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PALB2Q86YC2 1186 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAXDQ8IW45 347 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EBF1Q9UH73 591 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUV39H1O43463 412 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CBFA2T3O75081 653 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POU2F2P09086 479 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPP6P42658 865 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYT12Q8IV01 421 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF169Q8NCN4 708 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBOAT7Q96N66 472 aa9.89□□□□□ -0.83
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