RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.62■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MAGEB2O15479 319 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SLC10A3P09131 477 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MXI1P50539 228 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ACVR2BQ13705 512 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SLC35F6Q8N357 371 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 PASKQ96RG2 1323 aa20.61■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 LGALS2P05162 132 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SOX5P35711 763 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 CYP27A1Q02318 531 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MAP2K5Q13163 448 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TFDP1Q14186 410 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 VPS36Q86VN1 386 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 FAM81BQ96LP2 452 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 RCCD1A6NED2 376 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 F8VZ95 297 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ABL1P00519 1130 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MARK3P27448 753 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GPC3P51654 580 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 PSMD6Q15008 389 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 C17orf99Q6UX52 265 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TRIM50Q86XT4 487 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC102AQ96A19 550 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SAAL1Q96ER3 474 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TRPC6Q9Y210 931 aa20.6■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 A0A0B4J269 797 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ANO9A1A5B4 782 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GCLMP48507 274 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 IFNL1Q8IU54 200 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TRIM58Q8NG06 486 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.59■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TUBB4BP68371 445 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 PTK2Q05397 1052 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SREBF2Q12772 1141 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 USP6NLQ92738 828 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 CPA4Q9UI42 421 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 INTUQ9ULD6 942 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.58■□□□□ 0.89
HDAC10-204ENST00000429374 MSCO60682 206 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 TOM1L1O75674 476 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 GRM1Q13255 1194 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 MAPK6Q16659 721 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 AFG1LQ8WV93 481 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 CDC23Q9UJX2 597 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 NENFQ9UMX5 172 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.57■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 A0A087X0T9 212 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 EVI5O60447 810 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 TACC1O75410 805 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 C22orf31O95567 290 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 FAM228BP0C875 321 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 DRP2Q13474 957 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 KIF22Q14807 665 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 NAB2Q15742 525 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.56■□□□□ 0.88
HDAC10-204ENST00000429374 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms