RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 LRCH2Q5VUJ6 765 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 GRHL1Q9NZI5 618 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 BCS1LQ9Y276 419 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX3O60493 162 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM13AO94988 1023 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 OAS1P00973 400 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK7Q13164 816 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 CNGA2Q16280 664 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM20AQ96MK3 541 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 RASAL2Q9UJF2 1139 aa19.73■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 VCAM1P19320 739 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SREBF1P36956 1147 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGIRP43119 386 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCKSL1P49006 195 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 CROCCP2Q86T23 111 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 AMNQ9BXJ7 453 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ECT2Q9H8V3 914 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM198AQ9UFP1 575 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFAIP3P21580 790 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP2AO43633 222 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO1A2P46721 670 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 GALNTL6Q49A17 601 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 TPH2Q8IWU9 490 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT35Q92764 455 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 APEX2Q9UBZ4 518 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 GGT7Q9UJ14 662 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ALG6Q9Y672 507 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL21P46778 160 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE6CP51160 858 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 RDH13Q8NBN7 331 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF4Q8WV16 495 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF570Q96NI8 536 aa19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD62A6NC57 917 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 GAP43P17677 238 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF76P36508 570 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 AUHQ13825 339 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGRF2O14827 1237 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF2O75151 1096 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF131P52739 623 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 SLMAPQ14BN4 828 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CLUL1Q15846 466 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO11Q86XK2 927 aa19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 RIPK2O43353 540 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFR4P22455 802 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CCND1P24385 295 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC38Q502W7 563 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC27Q6P3X3 843 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 SIAH1Q8IUQ4 282 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 PRELID2Q8N945 189 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC17Q96LX7 622 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 FIZ1Q96SL8 496 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B14Q9BPX1 270 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 PARVGQ9HBI0 331 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 DIAPH2O60879 1101 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 SLITRK3O94933 977 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 COPS2P61201 443 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 MYL7Q01449 175 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIK3Q13003 919 aa19.69■□□□□ 0.74
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms