RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF131P52739 623 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STRN3Q13033 797 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRE1Q14246 886 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RESP18Q5W5W9 173 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYCT1Q8N699 235 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQUBQ8NA54 791 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX12PQ92771 950 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX58Q96C10 678 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLVAPQ9BX97 442 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDZD7Q9H5P4 517 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RSAD1Q9HA92 442 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBN1Q9NPG3 1134 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AAASQ9NRG9 546 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.11■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAG3P18627 525 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCP2P22307 547 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCKAP1LP55160 1127 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E2F4Q16254 413 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATF7IP2Q5U623 682 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DYMQ7RTS9 669 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 URGCPQ8TCY9 931 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC27Q9C0I9 530 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNMDQ9H2S6 317 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa19.1■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYMKA6NI61 221 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3BNC9 293 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 K7ENM7 598 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAK2O60296 914 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EDN1P05305 212 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPM6BQ13491 265 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOMO2Q5JPE7 1267 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADALQ6DHV7 355 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM178BQ8IXR5 827 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOL6Q9BWW8 343 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGEF1Q9HAY2 307 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP20Q9Y2K6 914 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HES2Q9Y543 173 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.09■□□□□ 0.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LPXNO60711 386 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OFD1O75665 1012 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAPTP10636 758 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCD1P33897 745 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMPD3Q01432 767 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPROQ16827 1216 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NT5DC1Q5TFE4 455 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAS1R3Q7RTX0 852 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HAUS6Q7Z4H7 955 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 P2RX5Q93086 422 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CWH43Q9H720 699 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HCSTQ9UBK5 93 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNH3Q9ULD8 1083 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFSF13BQ9Y275 285 aa19.08■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IDEP14735 1019 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAP43P17677 238 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CMA1P23946 247 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEF1DP3Q658K8 133 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNN1Q92952 543 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDM6Q9NQX0 595 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KBTBD4Q9NVX7 518 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMCD1Q9NZU5 365 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KANSL3Q9P2N6 904 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEL1LQ9UBV2 794 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIT1Q9Y2X7 761 aa19.07■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLH1P40692 756 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SFR1Q86XK3 245 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THNSL1Q8IYQ7 743 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MICALL1Q8N3F8 863 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL23Q8NBE8 558 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC19Q96DA6 116 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BICD1Q96G01 975 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF558Q96NG5 402 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF39Q9H2S5 420 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.06■□□□□ 0.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D13Q9NVG8 400 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms