RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 TCAF1Q9Y4C2 921 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TNKSO95271 1327 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 XPOTO43592 962 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF623O75123 536 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ALDH1L1O75891 902 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 OSMP13725 252 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCND1P24385 295 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 GZMKP49863 264 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDK17Q00537 523 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 HHEXQ03014 270 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 EFEMP1Q12805 493 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRM7Q14831 915 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPATS1Q496A3 300 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM111BQ6SJ93 734 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 DOK3Q7L591 496 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 FUKQ8N0W3 1084 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD35Q8N283 1001 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR7D4Q8NG98 312 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 JADE3Q92613 823 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARL8AQ96BM9 186 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CYFIP2Q96F07 1278 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 IL17RAQ96F46 866 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNRHR2Q96P88 292 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR14A2Q96R54 314 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPN18Q99952 460 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CSRNP2Q9H175 543 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CD248Q9HCU0 757 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TLR9Q9NR96 1032 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ING3Q9NXR8 418 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLA2G3Q9NZ20 509 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPRC5DQ9NZD1 345 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRPS1Q9UHF7 1281 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBE2QL1A1L167 161 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 B5MCH6 92 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TEX33O43247 280 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 FOXS1O43638 330 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SGTAO43765 313 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 AKR1B10O60218 316 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDHGA12O60330 932 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 DTNBO60941 627 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 NDUFS2O75306 463 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 S100BP04271 92 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 FLT3LGP49771 235 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP3CAQ08209 521 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SP140Q13342 867 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ICAM4Q14773 271 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ACAP2Q15057 778 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLEKHG6Q3KR16 790 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ODR4Q5SWX8 454 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 FKBP15Q5T1M5 1219 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP4R3AQ6IN85 833 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABHD15Q6UXT9 468 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MIGA2Q7L4E1 593 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 D2HGDHQ8N465 521 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CHST13Q8NET6 341 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR5M3Q8NGP4 307 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q8TCH9 128 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 HDAC10Q969S8 669 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 MIEF2Q96C03 454 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 LOXL4Q96JB6 756 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TEKT5Q96M29 485 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 LANCL2Q9NS86 450 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMPD4Q9NXE4 827 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 JAG2Q9Y219 1238 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 GIT1Q9Y2X7 761 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 TESMINQ9Y4I5 508 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms