RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PATJQ8NI35 1801 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 LAMTOR5O43504 91 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 TGM5O43548 720 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DSG1Q02413 1049 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PARM1Q6UWI2 310 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SHDQ96IW2 340 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 B3GALT6Q96L58 329 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 MIOSQ9NXC5 875 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SPTLC1O15269 473 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD10O75832 226 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SDHBP21912 280 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 LILRA6Q6PI73 481 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PHKBQ93100 1093 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 BCO2Q9BYV7 579 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CHST7Q9NS84 486 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GNA11P29992 359 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 BORCS6Q96GS4 357 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA4P13612 1032 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 FSHRP23945 695 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 NTHL1P78549 312 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DSC1Q08554 894 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ANO5Q75V66 913 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 RDM1Q8NG50 284 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 RNF39Q9H2S5 420 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 FAM170BA6NMN3 283 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYND10O75800 440 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 C1RP00736 705 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CD72P21854 359 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 TGM1P22735 817 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GAD1Q99259 594 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ARL5CA6NH57 179 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 MLH1P40692 756 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SCNN1GP51170 649 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 USP11P51784 963 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 NPEPPSP55786 919 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP8P85298 464 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PRKCQQ04759 706 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ST3GAL2Q16842 350 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 TSSK4Q6SA08 328 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP42Q96MM3 310 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 FNIP2Q9P278 1114 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 CDH7Q9ULB5 785 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 IPPQ9Y573 584 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 LILRB5O75023 590 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 FUT10Q6P4F1 479 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CNNM3Q8NE01 707 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 BICD2Q8TD16 824 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 NELL1Q92832 810 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM143Q96AN5 459 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 MBOAT7Q96N66 472 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms