RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MCL1Q07820 350 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMC2Q13753 1193 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC51BQ86UW2 128 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 RMDN1Q96DB5 314 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 IFT43Q96FT9 208 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR24Q96S15 920 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CARD6Q9BX69 1037 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PARVBQ9HBI1 364 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 DACH1Q9UI36 760 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAAQ9Y263 795 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ACEP12821 1306 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SNTNA6NMZ2 147 aa7.3□□□□□ -1.24
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RABGEF1-202ENST00000380828 HPGDP15428 266 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP1P32455 592 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ACSL1P33121 698 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K7CLP57077 242 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TMF1P82094 1093 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP100Q494V2 611 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 AARDQ4LEZ3 155 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 MED30Q96HR3 178 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 HES6Q96HZ4 224 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 RMND1Q9NWS8 449 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NL46 340 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 KMOO15229 486 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYZL1O95825 349 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXD13P35453 343 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TXLNAP40222 546 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 EPS15P42566 896 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1G1P47890 313 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP6P59044 892 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GCNT1Q02742 428 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 DDI1Q8WTU0 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 LY9Q9HBG7 655 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAPD2Q15021 1401 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8RI6L899 631 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCY1B2O75343 617 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PDHA1P08559 390 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 WEE2P0C1S8 567 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ALADP13716 330 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPA6P17066 643 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 POU3F4P49335 361 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GALK1P51570 392 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR85P60893 370 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 Q3ZCU0 254 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF365Q70YC5 407 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX9Q8N6V9 391 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SNF8Q96H20 258 aa7.3□□□□□ -1.24
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RABGEF1-202ENST00000380828 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP25P42331 645 aa7.29□□□□□ -1.24
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RABGEF1-202ENST00000380828 VPS41P49754 854 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 PPFIA1Q13136 1202 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 ANO4Q32M45 955 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM209BQ5JX69 171 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 USP43Q70EL4 1123 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM71BQ8TC56 605 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 NGLY1Q96IV0 654 aa7.29□□□□□ -1.24
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