RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 APBB2Q92870 758 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 VWCEQ96DN2 955 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 CHST12Q9NRB3 414 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 DACH1Q9UI36 760 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TNFSF13BQ9Y275 285 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TGFB1I1O43294 461 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TOM1L1O75674 476 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TCHPQ9BT92 498 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 FUCA2Q9BTY2 467 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 N4BP3O15049 544 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TCTN1Q2MV58 587 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 NELFBQ8WX92 580 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 SEMA6BQ9H3T3 888 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 IL23AQ9NPF7 189 aa29.02■■■□□ 2.24
GGTA1P-201ENST00000373793 MGEA5O60502 916 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ACRP10323 421 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 RGS19P49795 217 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF568Q3ZCX4 644 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ZBTB33Q86T24 672 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 P2RX5Q93086 422 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ADAM2Q99965 735 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PDXKO00764 312 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CLDN3O15551 220 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PFKMP08237 780 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PROZP22891 400 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PAK1Q13153 545 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 DSC3Q14574 896 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CENPPQ6IPU0 288 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 MPZL3Q6UWV2 235 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC51Q96ER9 411 aa29■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CLIC2O15247 247 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CCNE1P24864 410 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ADSSP30520 456 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 SLFN12LQ6IEE8 588 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 POMGNT1Q8WZA1 660 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ABLIM1O14639 778 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 NPTXRO95502 500 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 STX17P56962 302 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 TSG101Q99816 390 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CBWD1Q9BRT8 395 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 HAPLN2Q9GZV7 340 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 STYXL1Q9Y6J8 313 aa28.99■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 IKBKEQ14164 716 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 UBXN11Q5T124 520 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CDT1Q9H211 546 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 PCIF1Q9H4Z3 704 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 BICDL2A1A5D9 508 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 MCL1Q07820 350 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 MSTO1Q9BUK6 570 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 RGS18Q9NS28 235 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 A0A0B4J269 797 aa28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 GARTP22102 1010 aa28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 LRRC63Q05C16 580 aa28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.96■■■□□ 2.23
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms