RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
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NCKAP1-201ENST00000360982 KCNB1Q14721 858 aa21.89■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.89■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.091e-9■□□□□ 8.8
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NCKAP1-201ENST00000360982 STILQ15468 1287 aa21.88■■□□□ 1.09
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NCKAP1-201ENST00000360982 FAF2Q96CS3 445 aa21.88■■□□□ 1.09
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NCKAP1-201ENST00000360982 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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NCKAP1-201ENST00000360982 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 FCGRTP55899 365 aa21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 LAMC2Q13753 1193 aa21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1-201ENST00000360982 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.84■■□□□ 1.09
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