RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RFC2P35250 354 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC10P48553 1259 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PTPAQ15257 358 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SURF1Q15526 300 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 OXER1Q8TDS5 423 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF560Q96MR9 790 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 COL4A5P29400 1685 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MMP1P03956 469 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CYBBP04839 570 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IQCF3P0C7M6 154 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NTRK3Q16288 839 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MORN1Q5T089 497 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TTC8Q8TAM2 541 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PNMA5Q96PV4 448 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 USP18Q9UMW8 372 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HES2Q9Y543 173 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HMBSP08397 361 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IRF1P10914 325 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FGFR1P11362 822 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CKBP12277 381 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCA1P28370 1054 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT2P49753 483 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GPC3P51654 580 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HIC1Q14526 733 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SEZ6Q53EL9 994 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM192Q8IY95 271 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RNF214Q8ND24 703 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RDM1Q8NG50 284 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ANKS1AQ92625 1134 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM206Q9H813 350 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LTBP1Q14766 1721 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM150BA6NC51 233 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NCK2O43639 380 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HIP1RO75146 1068 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYND10O75800 440 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 WEE2P0C1S8 567 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GAP43P17677 238 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ABCD1P33897 745 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ST8SIA6P61647 398 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SNTG2Q9NY99 539 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 Q9Y3F1 56 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 STK36Q9NRP7 1315 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC172P0C7W6 258 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MLH1P40692 756 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 USP41Q3LFD5 358 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.642e-7■■■□□ 16.8
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